Journal articles
Le RMQS au service de l'écologie microbienne des sols français
Samuel Dequiedt
1
Battle Karimi
1
Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré
1
Sébastien Terrat
1
Walid Horrigue
1
Christophe Djemiel
1
Mélanie Lelievre
1
Virginie Nowak
1
Patrick Wincker
2
Claudy Jolivet
3
Nicolas P.A. Saby
3
Dominique Arrouays
3
Antonio Bispo
3
Isabelle Feix
4
Thomas Eglin
4
Philippe Lemanceau
1
Pierre-Alain Maron
1
Lionel Ranjard
1
Samuel S. Dequiedt 1
Author
Battle Karimi 1
Author
Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré 1
Author IdHAL : nicolas-chemidlin-prevost-boure ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/U-7714-2017 ORCID : https://orcid.org/0000-0002-8575-4295
Sébastien Terrat 1
Author
Walid Horrigue 1
Author
Christophe Djemiel 1
Author
Mélanie M. Lelievre 1
Author
Virginie Nowak 1
Author
Patrick Wincker 2
Author
Claudy Jolivet 3
Author
Nicolas P.A. Saby 3
Author IdHAL : nicolas-sabyds ORCID : https://orcid.org/0000-0001-8964-1194
Dominique Arrouays 3
Author
Antonio Bispo 3
Author IdHAL : antonio-bispo ORCID : https://orcid.org/0000-0002-6985-8385
Isabelle Feix 4
Author
Thomas Eglin 4
Author
Philippe P. Lemanceau 1
Author
Pierre-Alain Maron 1
Author
Lionel Ranjard 1
Author
1
Agroécologie [Dijon] (Agroécologie, AgroSup Dijon, INRAE, Univ. Bourgogne, Univ. Bourgogne Franche-Comté, F-21000 Dijon, France - France)
- UB - Université de Bourgogne (Maison de l'université - Esplanade Érasme - BP 27877 - 21078 Dijon cedex - France)
- AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement : UMR1347 (26 Boulevard du Dr Petitjean - BP 87999 - 21079 Dijon cedex - France)
- UBFC - Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (France)
- INRAE - Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement : UMR INRA 1347 (France)
2
GENOSCOPE - Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (2, rue Gaston Crémieux CP5706 91057 EVRY Cedex - France)
- Université Paris-Saclay (Espace Technologique, Bat. Discovery - RD 128 - 2e ét., 91190 Saint-Aubin - France)
- DRF (CEA) - Direction de Recherche Fondamentale (CEA) : DRF/JACOB (Direction de Recherche Fondamentale
Fundamental Research Division
CEA Saclay
91191 Gif-sur-Yvette
- France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
3
InfoSol - InfoSol (2163, avenue de la Pomme de Pin -
CS 40001 -
45075 ORLEANS CEDEX 2 - France)
4
ADEME - Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (20 Avenue du Grésillé, 49000 Angers, France - France)
Résumé : L'écologie microbienne des sols a longtemps été reconnue comme souffrant d'un certain manque de généricité car les études ont souvent été menées à l'échelle de parcelles voire de petits territoires et avec peu de sites investigués. Il en résulte un manque de connaissances sur les processus de distribution des populations et de la régulation de la diversité microbienne à grande échelle face à des modifications environnementales dues aux usages des terres ou au changement climatique. Dans les années 2000, le RMQS, avec 2 240 sites échantillonnés sur toute la France, a représenté une opportunité unique pour étudier les micro-organismes du sol sur de grandes échelles spatiales et ainsi développer un nouveau domaine scientifique : la biogéographie microbienne. Presque 20 ans après, cet article fait le bilan des connaissances qui ont été obtenues par l'application d'outils modernes de biologie moléculaire sur les sols du RMQS pour analyser l'abondance et la diversité des communautés microbiennes à l'échelle de la France. En plus des avancées fondamentales, ce bilan inclut les avancées finalisées qui ont permis de développer et de valider de nouveaux indicateurs microbiens de la qualité des sols et qui sont aujourd'hui directement opérables par les usagers du sol.
Document type :
Journal articles
Domain :
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https://hal-agrosup-dijon.archives-ouvertes.fr/hal-02540019
Contributor : Admin Agrosupdijon Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Friday, April 10, 2020 - 3:36:29 PM
Last modification on : Tuesday, May 25, 2021 - 2:54:02 PM
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Identifiers
- HAL Id : hal-02540019, version 1
Collections
AGROSUP-DIJON | AGROSUP-AE | UNIV-BOURGOGNE | ADEME | CEA | CEA-UPSAY | JACOB | CEA-DRF | GENOSCOPE | INRAE
Citation
Samuel Dequiedt, Battle Karimi, Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré, Sébastien Terrat, Walid Horrigue, et al.. Le RMQS au service de l'écologie microbienne des sols français. Etude et Gestion des Sols, Association Française pour l'Etude des Sols, 2020, 27 (1), pp.51-71. ⟨hal-02540019⟩
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